软件著作权登记证书是对登记事项的初步证明，可以帮助持有者在诉讼中起到减轻举证责任的作用。

根据国务院颁发的《鼓励软件产业和集成电路产业发展的若干政策》的有关规定，登记证书可以作为软件企业申请减免税收、取得双软认证（软件产品、软件企业认证）的证明。

官方发布的登记公告可作为软件开发者、软件企业查询软件信息的依据，为打击软件盗版、识别和推广使用正版软件提供帮助。

符合条件的申请人可以凭登记证书申请政府相关费用资助。